Temeljni su ciljevi BNZ zaštita, razvijanje i promicanje etničkih, nacionalnih, kulturnih i socijalnih prava i interesa Bošnjaka u Republici Hrvatskoj, razvijanje i podupiranje dobrih odnosa između bošnjačkog u Republici Hrvatskoj te suradnja s državnim tijelima, institucijama i udruženjima matične domovine Bosne i Hercegovine. Afirmacija nacionalnih vrijednosti i zastupljenost Bošnjaka na svim razinama društvenog i političkog života Hrvatske predstavljaju značajne sastavnice djelovanja. Zajednica ispunjava svoje ciljeve kroz različite forme djelovanja: promocije knjiga, tribine, održavanje koncerata i kazališnih predstava, izložbe, organizaciju znanstvenih skupova, kulturne manifestacije s predstavljanjem bošnjačke kulture i tradicije, obilježavanje značajnih datuma iz povijesti i državnih praznika Bosne i Hrercegovine.